Материалът в ръководството е структуриран по теми, чрез които последователно се изучават строежът на растителната клетка, растителните тъкани и растителните органи. Всяка тема започва с теоретична постановка и приключва с три типа въпроси: контролни, дискусионни и обобщаващи. Чрез тях се осъществява самоконтрол и самопреценка за наученото и се достига до изводи и заключения, основаващи се на конкретните изследвания. В зависимост от естеството на материала темите са различни по обем и някои от тях следва да се разработват в две или повече лабораторни занятия.

Ръководството е богато илюстрирано с фигури, които съответстват на обектите от задачите. Чрез фигурите студентите получават ориентация, която им позволява директно да се насочат към изучаваните микроскопски структури и да намерят необходимото в многообразието от форми, с тяхна помощ те сравняват и коригират собствените си схеми и рисунки от наблюденията и изграждат важното за всеки биолог умение за документация.

Всеки от разделите приключва с обобщаващи задачи, а целият курс –  с два контролни анализа: морфологичен и органографски. Анализите имат характер на самостоятелни малки изследователски задачи, изискващи творческа аналитичност. Те целят да се стимулира творческото участие на студентите в учебния процес.